Od července nabízí Mercedes-Benz pohon 4x4 (4matic) v řadě E také pro naftové motory 280 CDI a 320 CDI (140 a 165 kW); až do nynějška byl pohon všech kol výsadou benzínů - E280, E350 a E500. Silnější nafťák se s pohonen 4matic rozjede na stovku za 7,4 s, dosáhne rychlost 244 km/h a spotřebuje 7,9-8,1 l nafty na sto km. Stejnou spotřebu má i 280 CDI, ovšem na stovku se dostane až za 8,2 s a rozjede se pouze na 234 km/h. Oba modely mají v základu filtr pevných částic.